Chi bộ trường THCS Trần Quốc Toản được thành lập từ rất sớm. Quá trình trưởng thành và phát triển của chi bộ luôn gắn liền với từng bước đi lên của nhà trường, với nhiệm vụ chính trị đặc biệt là lãnh đạo toàn diện nhà trường thực hiện tốt nhiệm vụ năm học.